N⁶-甲基腺苷(m⁶ A)甲基化可通过RNA甲基转移酶复合物(MTC)沉积在染色质相关RNA (caRNAs)上，调控染色质状态和转录。然而，MTC被募集到不同基因组位点的机制仍然难以捉摸。

2023年8月28日，芝加哥大学何川、陈梦洁及贝克曼研究中心陈建军共同通讯在Nature Cell Biology 在线发表题为“RBFOX2 recognizes N⁶-methyladenosine to suppress transcription and block myeloid  leukaemia differentiation”的研究论文，该研究发现RBFOX2识别N⁶-甲基腺苷抑制转录，阻断髓性白血病分化。

RBFOX2可以募集MTC成分RBM15，促进启动子相关RNA的甲基化。RBM15也与YTHDC1物理相互作用，将多梳抑制复合体2 (PRC2)募集到RBFOX2结合的位点，从而实现染色质沉默和转录抑制。此外，作者发现RBFOX2/m⁶A/RBM15/YTHDC1/PRC2轴在髓性白血病中起关键作用。下调RBFOX2显著抑制急性髓系白血病细胞的存活/增殖，促进其髓系分化。RBFOX2也是白血病干细胞/起始细胞自我更新和急性髓性白血病维持所必需的。该研究提出了m⁶AMTC募集和m⁶A沉积在caRNAs上的途径，导致位点选择性染色质调节，这对白血病具有潜在的治疗意义。

m⁶A是哺乳动物细胞中最常见的信使RNAs。由m⁶A甲基转移酶复合物(MTC)安装，由METTL3/14、WTAP7、RBM15/15B8、ZC3H13和VIRMA (KIAA1429)组成，并且可以被去甲基化酶FTO11和ALKBH5去除。m⁶A对mRNA代谢和翻译的功能影响是通过m⁶A阅读蛋白介导的，例如含有YTH结构域的蛋白(YTHDC1/2)、YTHDF1/2/3。可以通过直接或间接机制优先结合m⁶A修饰转录本的阅读器蛋白列表，包括IGF2BP1/2/3、HNRNPA2B1、HNRNPC和HuR，还在继续扩大。

虽然m⁶A在转录后mRNA衰变和翻译调控中的关键作用已经得到了很好的证实，但最近的研究也表明，METTL3/METTL14复合体可以介导非编码染色质相关RNAs (caRNAs)的m⁶A甲基化，从而调节染色质状态并调控转录；然而，MTC如何被募集到不同的染色质位点以及它如何实现位点选择调控在很大程度上是未知的。此外，YTHDC1是唯一被鉴定的m⁶A与染色质调控相连接的阅读蛋白。然而，如何募集YTHDC1参与m⁶A依赖性的位点选择性调控尚不清楚。

机理模式图（图源自Nature Cell Biology）

该研究展示了一个涉及MTC、YTHDC1和RNA结合蛋白(RBP) RBFOX2的转录调控轴：RBFOX2募集MTC成分RBM15来甲基化启动子相关RNAs (paRNAs)。RBM15进一步与YTHDC1相互作用，将PRC2募集到RBFOX2结合的位点进行转录抑制。RBFOX2/ m⁶A/RBM15/YTHDC1/PRC2轴在髓性白血病中发挥重要作用，下调RBFOX2可显著抑制急性髓性白血病(AML)细胞的存活/增殖，促进AML细胞向髓性分化。因此，RBFOX2被认为是一种染色质因子，在位点特异性染色质调节过程中促进m⁶A沉积在caRNAs上，具有治疗白血病的意义。

综上，该研究揭示了RBFOX2作为染色质上的m⁶A结合蛋白在促进caRNA甲基化以抑制转录方面的功能作用。这种调控模式填补了染色质和caRNAs的m⁶A甲基化之间的串扰中一个关键的缺失环节。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41556-023-01213-w